Grundkurs i molekylmodellering

1a: Vad menas med symmetrioperationen σ_h i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med symmetrioperationen C₃ i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med symmetrioperationen C₂ i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med symmetrioperationen S₄ i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med inversion i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med identitetsoperation i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med symmetrioperationen σ_v i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med huvudaxel i punktgruppernas teori?

1a: Vad menas med begreppet symmetrioperation i punktgruppernas teori?

1b: Vad berättar bikvanttalet om en atomorbitals egenskaper?

1b: Vad berättar det magnetiska kvanttalet om en atomorbitals egenskaper?

1b: Vad allt berättar symbolen 2p_x om en atomorbitals egenskaper?

1b: Vad berättar orbitalenergin om en atomorbitals egenskaper?

1b: Vad berättar vågfunktionen om en atomorbitals egenskaper?

1b: Vad är HOMO för någonting?

1b: Vad är LUMO för någonting?

1b: Vad menas med begreppet MO-LCAO?

1c: Vad menas med begreppet torsion?

1c: Vad menas med begreppet torsionsbarriär?

1c: Vad menas med begreppet bindningsordning?

1c: Vad menas med begreppet koordinationsbindning?

1c: Vad menas med en komplexförening?

1c: Vad betyder begreppet potentialenergibarriär i en potentialenergikurva?

1c: Vad menas med en kelat?

1d: Visa enhetscellen i serien ...ABBCBBAABBCBBAABBCBBAABBCBBA...!

1d: Vad menas med enhetscell i kristallint material?

1d: Var någonstans i en kub ligger punkten (0.5, 0.5, 0.5)?

1d: Var någonstans i en kub ligger punkten (0.5, 0.5, 0.0)?

1d: Var någonstans i en kub ligger punkten (0.5, 0.0, 0.0)?

1d: Vad menas med symmetrioperationen translation i kristallint material?

1e: Vad menas med sp² hybridisering?

1e: Vad menas med sp³ hybridisering?

1e: Vad menas med N-terminus av en polypeptid?

1e: Vad menas med C-terminus av en polypeptid?

1e: Vad menas med protein?

1f: Visas inte!

2: Till vilken punktgrupp hör ammoniakmolekylen NH₃?

2: Till vilken punktgrupp hör molekylen cis-1,2-dikloreten? Observera, att molekylen är plan.

2: Till vilken punktgrupp hör molekylen trans-1,2-dikloreten? Observera, att molekylen är plan.

2: Till vilken punktgrupp hör molekylen cycklopentadien, C₅H₅? Observera, att molekylen är plan.

3: Nedan ges Hückels lösning för allylkatjonen C₃H₅⁺. Visualisera de tre molekylorbitalerna med figurer!

3: Konstruera Hückels koefficientmatris för molekylen cycklopentadien, C₅H₅,

3: Vad är ett konjugerat bindningssystem? Vad är en aromatisk förening?

3: Nedan ges Hückels lösning för allylkatjonen C₃H₅⁺. Molekylen har två elektroner i π orbitalerna. Räkna antalet π elektroner i närheten av atom 1!

4: Hur många atomer finns i enhetscellen i figuren nedan? Atomerna är lika och visas som sfärer i figuren.

4: (a) Vad menas med Millers index i kristallstrukturer? (4 p)
(b) Ge Millers index för den skuggade ytan i figuren nedan! (2 p)

4: Vad är ett konjugerat bindningssystem? Vad är en aromatisk förening?

4: Vad menas med begreppet stereoisomer? Definiera begreppet och illustrera med ett exempel!

4: Vad är en kovalent och en jonisk bindnng? Hur skiljer de från varandra?

4: (a) Vad menas med konjugerade dubbelbindningar?
(b) Vad berättar resonansstrukturerna om bindningarna i molekyler med ett konjugerat π-system?
(c) Rita resonansstrukturerna för fenantren.

4: Fenantren är en av de giftiga PAH föreningarna (polyaromatiska kolväten), som förekommer i förbränningsgaserna. Nedan ges en av molekylens möjliga resonansstrukturer. Rita de övriga resonansstrukturerna.

4: Vad menas med begreppet isomer? Definiera begreppet och illustrera med ett exempel!

4: Beskriv molekylmekanikmetodens grundprincip.

5: a) Rita en reaktionsekvation, som visar hur en peptidbindning bildas mellan två aminosyramolekyler. (3 p)
b) Rita resonansstrukturerna för en peptidbindning. (2 p)
c) Vad är en protein? (1 p)

5: Förklara vad en peptidbindning är för någonting.

5: Vad menas med Van der Waals krafter?

5: Betrakta 2-metylpropan-2-ol (tertbutylalkohol). Skissera potentialenergikurvan för torsionen genom C-O bindningen inom intervallet 0 - 360^o.

5: Den optimala geometrin för föreningen klormetylformiat är Z, ap. Vissa semiempiriska metoder som t.ex. CNDO överestimerar "femring"-strukturens stabilitet och förutspår, att Z, sp skulle vara den energetiskt fördelaktigaste strukturen. Betrakta den felaktiga strukturen Z, sp. Är avståndet mellan karbonylsyreatomen och kloratomen a) 29.4 pm; b) 294 pm; c) 2.94 nm; eller d) 29.4 nm?

5: Nedan visas strukturen av cycklohexan (stolform). Är avståndet mellan kolatomerna A och B (a) 0.298 nm; (b) 2.98 nm; (c) 29.8 nm;eller (d) 298 nm?

5: Förklara vari ligger skillnaden mellar Brönstedts syra-bas teori och Lewis generaliserade syra-bas teori.